| Gabriel Fauré – 4 : Dolly / 4 mains / Masques et bergamasques / Fantaisie, op. 79 / Trio, op. 120 | Gabriel Fauré; Le Sage, Tharaud, Pahud, Colombet, Merlin | Digital Media | 23 | | Alpha Productions | ALPHA 603 | 3760014196034 |
| Gabriel Fauré – 4 : Dolly / 4 mains / Masques et bergamasques / Fantaisie, op. 79 / Trio, op. 120 | Gabriel Fauré; Le Sage, Tharaud, Pahud, Colombet, Merlin | CD | 23 | | Alpha Productions | ALPHA 603 | 3760014196034 |
| Horizons | Gabriel Fauré; Pierre Fouchenneret, Simon Zaoui, Raphaël Merlin, David Lefort | 2×CD | 14 + 14 | | Aparté | AP162 | 3149028115024 |
| Cello Concertos | Jacques Offenbach, Friedrich Gulda; Edgar Moreau, Les Forces Majeures, Raphaël Merlin | CD | 8 | | Erato | | 0190295526122 |
| Cello Concertos | Jacques Offenbach, Friedrich Gulda; Edgar Moreau, Les Forces Majeures, Raphaël Merlin | Digital Media | 8 | | | | |
| Schubert: Octet / Merlin: Passage éclair | Schubert, Merlin; Pierre Fouchenneret, Shuichi Okada, Marc Desmons, Yan Levionnois, Yann Dubost, Nicolas Baldeyrou, Julien Hardy, David Guerrier | Digital Media | 7 | | Alpha Classics | | 3760014196232 |
| Schubert: Octet / Merlin: Passage éclair | Schubert, Merlin; Pierre Fouchenneret, Shuichi Okada, Marc Desmons, Yan Levionnois, Yann Dubost, Nicolas Baldeyrou, Julien Hardy, David Guerrier | CD | 7 | | Alpha Classics | ALPHA 623 | 3760014196232 |
| ’Round Midnight | Dutilleux, Merlin, Schoenberg; Quatuor Ébène, Antoine Tamestit, Nicolas Altstaedt | Digital Media | 31 | | Warner Classics | | 190296641886 |
| Horizons II | Gabriel Fauré; Simon Zaoui, Pierre Fouchenneret, Raphaël Merlin, Marie Chilemme, Quatuor Strada | 3×CD | 9 + 7 + 3 | | Aparté | AP273 | 5051083175548 |
| Horizons II | Gabriel Fauré; Simon Zaoui, Pierre Fouchenneret, Raphaël Merlin, Marie Chilemme, Quatuor Strada | Digital Media | 19 | | Aparté | AP273 | 3149028138825 |